Церковь святителя Николая была построена в IV веке и была разрушена землетрясением и арабами. Современный храм был возведен около VIII века. В XI веке церковь была преобразована в монастырь и окружена крепостной стеной. В 1087 году мощи святителя Николая были выкрадены итальянскими купцами. Церковь была затоплена грязевыми водами реки Мирос, но была раскопана в конце XVIII – начале XIX вв. В начале 1858 года начались восстановительные работы, которые вызвали беспокойство Константинопольского Патриархата и турецких властей.